Funcția izolatorilor este direcțională, așa cum s-a descoperit în experimentele cu muștele fructelor. țiganul a fost introdus în locusul galben al Drosophila melanogaster, rezultând inactivarea genei y în unele țesuturi, dar gena y era încă activă în unele țesuturi, deoarece exista o secvență izolatoare la un capăt al țiganului. țiganul va avea efecte diferite asupra activității genelor atunci când țiganul este inserat în diferite locații din locusul y. Acest lucru se datorează faptului că activitatea genei y este reglată de patru amplificatori. Când izolatorul este introdus chiar în amonte de promotor, acesta blochează activarea genelor în lama aripii și țesuturile cuticulei corpului (de la amplificatorul din amonte). Dar nu a blocat expresia genei y (de la amplificatorul din aval) în perii și ghearele farsale.
Deoarece unii amplificatori sunt în amonte și alții în aval de promotor, efectul izolatorului nu depinde de poziția izolatorului față de promotor. Prin urmare, motivul directivității efectului izolator nu este înțeles cu adevărat. S-a descoperit că doi loci afectează funcția izolatorului într-o manieră de transactivare. Nucleoproteina codificată de gena S2J(Hw) recunoaște izolatorul și numai după ce izolatorul se leagă de acesta are un efect izolator. Când această genă este mutată, efectul de izolație se pierde în ciuda inserției unui izolator în locusul y și y este exprimat în toate țesuturile. Un alt loc este mod(mdg 4). După mutația acestei gene, efectul ei este chiar opus cu Su(Hw), adică acești mutanți sporesc efectul de izolație, făcând ca efectul de izolație al izolatorului să nu mai fie direcțional și extins, adică blocând efectul amplificatorilor asupra ambelor. părţile amonte şi aval.
